Unsere Forschung
Bakterielle Infektionen höherer Säugetiere sind die Folge komplexer biologischer Prozesse in Organismen, die unterschiedlicher kaum sein könnten. Wie fördern pathogene Bakterien Infektionen und mittels welcher Mechanismen gelingt die Kolonisierung des Wirts? Welche molekularen Mechanismen bilden den Schutz eines potentiellen Wirts durch ansässige Mikroorganismen? Und welche Rolle spielen dabei nicht-kodierende RNAs? Diesen und ähnlichen Fragen gehen wir durch unsere Forschung nach. Mit Hilfe neuester RNA-Sequenzierungstechniken, die von uns auf komplexe Infektionssysteme angewandt werden, identifizieren und charakterisieren wir nicht-kodierende RNA-Moleküle in Pathogenen, sowie im Wirt und dessen kommensalen Mikroorganismen. Hierbei suchen wir nach geeigneten RNAs, die als Biomarker für die Diagnostik oder als Ziel therapeutischer Eingriffe dienen könnten.
Unsere Forschung
Bakterielle Infektionen höherer Säugetiere sind die Folge komplexer biologischer Prozesse in Organismen, die unterschiedlicher kaum sein könnten. Wie fördern pathogene Bakterien Infektionen und mittels welcher Mechanismen gelingt die Kolonisierung des Wirts? Welche molekularen Mechanismen bilden den Schutz eines potentiellen Wirts durch ansässige Mikroorganismen? Und welche Rolle spielen dabei nicht-kodierende RNAs? Diesen und ähnlichen Fragen gehen wir durch unsere Forschung nach. Mit Hilfe neuester RNA-Sequenzierungstechniken, die von uns auf komplexe Infektionssysteme angewandt werden, identifizieren und charakterisieren wir nicht-kodierende RNA-Moleküle in Pathogenen, sowie im Wirt und dessen kommensalen Mikroorganismen. Hierbei suchen wir nach geeigneten RNAs, die als Biomarker für die Diagnostik oder als Ziel therapeutischer Eingriffe dienen könnten.
Prof. Dr. Alexander Westermann
Infektionen stellen ein komplexes Zusammenspiel zwischen Pathogenen, ihrem Wirt und den ansässigen Mikroorganismen dar. Sie zu verstehen – und letztlich zu behandeln – wird nur möglich sein, wenn wir die Rolle aller Akteure berücksichtigen.
Alexander Westermann studierte Molekulare Biowissenschaft an der Universität Heidelberg und arbeitete 2009 als Gastwissenschaftler an der UC Berkeley (Kalifornien, USA). Er promovierte in der Arbeitsgruppe von Prof. Jörg Vogel am Institut für Molekulare Infektionsbiologie (IMIB) in Würzburg. 2017 und 2018 war er als Gastwissenschaftler in den Arbeitsgruppen von Prof. Andreas Bäumler (UC Davis, USA) und Prof. David Holden (Imperial College London, UK) tätig. Seit März 2018 ist er Juniorprofessor am IMIB, sowie Leiter der HOPI-Arbeitsgruppe am HIRI.
Ausgewählte Publikationen
Ryan D, Bornet E, Prezza G, Varshini Alampalli S, Franco de Carvalho T, Felchle H, Ebbecke T, Hayward R, Deutschbauer AM, Barquist L, Westermann AJ (2024)
An expanded transcriptome atlas for Bacteroides thetaiotaomicron reveals a small RNA that modulates tetracycline sensitivity.
Nature Microbiology 9(4):1130-1144.
Prezza G, Liao C, Reichardt S, Beisel CL, Westermann AJ (2024)
CRISPR-based screening of small RNA modulators of bile susceptibility in Bacteroides thetaiotaomicron.
PNAS 121(6):e2311323121.
Westermann AJ*,+, Vogel J*,+ (2021)
Cross-species RNA-seq for deciphering host-microbe interactions.
Nature Reviews Genetics 22(6):361-378.
Ryan D, Jenniches L, Reichardt S, Barquist L, Westermann AJ (2020)
A high-resolution transcriptome map identifies small RNA regulation of metabolism in the gut microbe Bacteroides thetaiotaomicron.
Nature Communications 11(1):3557.
Westermann AJ, Förstner KU, Amman F, Barquist L, Chao Y, Schulte LN, Müller L, Reinhardt R, Stadler PF, Vogel J
Dual RNA-seq unveils noncoding RNA functions in host-pathogen interactions
Nature 2016, 529(7587): 496-501
