Doktorand_in (w/m/d) Projekttitel: Analyse bakterieller Symbionten auf Basis von Naturprodukten
- Forschungsgruppe
- Antiinfectiva aus Microbiota
- Einstellungszeitpunkt
- Zum nächstmöglichen Zeitpunkt
- Befristung
- Zunächst für drei Jahre befristet
- Probezeit
- 6 Monate
- Vergütung
- Angelehnt an E 13 TVöD Bund
- Bewerbungsfrist
- 30.10.2024
Das Helmholtz-Institut für Pharmazeutische Forschung Saarland (HIPS) konzentriert sich auf die Identifizierung und Entwicklung neuer Behandlungsmöglichkeiten für Infektionskrankheiten mit Schwerpunkt auf der Naturstoffforschung. Das HIPS wurde im August 2009 gemeinsam vom HZI in Braunschweig und der Universität des Saarlandes auf dem Campus Saarbrücken gegründet.
Im Jahr 2015 bezog das HIPS ein neues 4500 m2 großes Forschungsgebäude, in dem derzeit 220 internationale Mitarbeiter tätig sind. Das HIPS ist die erste und einzige öffentlich finanzierte außeruniversitäre Forschungseinrichtung in Deutschland, die sich der pharmazeutischen Forschung widmet. Das Institut arbeitet mit Universitäten und verschiedenen Industriezweigen im In- und Ausland zusammen. Forscher der Abteilung Antiinfektiva aus Mikrobiota analysieren und identifizieren neuartige Naturstoffe aus einzigartigen Bakterienarten und mikrobiellen Konsortien unter Anwendung verschiedener Ansätze und Methoden, hauptsächlich aus den Bereichen Biotechnologie, Mikrobiologie, Molekularbiologie und Biochemie.
Das Promotionsprojekt META-NAT konzentriert sich auf die Identifizierung neuer bakterieller Naturstoffproduzenten und die Stoffwechselanalyse von deren Gemeinschaften. Das Projekt wird modernste mikrobiologische Techniken und Sequenzierungstechnologien nutzen und die Bakterienkultivierung mit der Entdeckung von Naturstoffen kombinieren, um die natürlichen Funktionen von Sekundärmetaboliten zu verstehen.
Das Promotionsprojekt gliedert sich in zwei miteinander verbundene Forschungssäulen:
- Stoffwechselanalyse von bakteriellen Naturstoffproduzenten
- Schwerpunkt auf der Analyse des Sekundärmetaboloms von bakteriellen Produzenten
- Einsatz hochauflösender Massenspektrometrie zur Überwachung und Optimierung der Produktbildung
- Isolierung neuer Naturstoffe und strukturelle Charakterisierung
- Genomsequenzierung von bakteriellen Naturstoffproduzenten und Analyse des Biosynthesewegs
- Isolierung von DNA und Sequenzierung des gesamten Genoms
- Genom-Mining für kryptische und ungewöhnliche Biosynthesewege
- Gegebenenfalls Klonierung von Biosynthesegenen für die Analyse des Biosynthesewegs oder die Manipulation des Produktionswirts
Aufgaben
Im Rahmen dieses Projekts wird der erfolgreiche Kandidat zur Kultivierung neuartiger Bakterienarten beitragen und die Bemühungen zur Genomsequenzierung für das Genom-Mining und vergleichende Studien anführen. Die Analyse der Fermentationsbedingungen wird Studien zum Naturstoffrepertoire anstoßen. Ein besonderer Schwerpunkt sollte auf der Identifizierung neuartiger Naturstoffe liegen. Der Doktorand hat die Möglichkeit, sich an modernsten Analysegeräten schulen zu lassen und dieses Wissen für die Identifizierung von Naturstoffen zu nutzen. Dieser vielseitige Ansatz ermöglicht es dem Kandidaten, Fachwissen über mikrobielle Kultivierungstechniken zu erwerben und fortschrittliche molekularbiologische und analytische Werkzeuge zur Identifizierung neuer Naturstoffe anzuwenden. Neuartige chemische Strukturen sollten z. B. durch Massenspektrometrie und Kernspinresonanztechniken aufgeklärt werden.
Voraussetzungen
- Master-Abschluss oder gleichwertiger Abschluss in Chemie, Biotechnologie, Pharmazie, Biowissenschaften oder verwandten Bereichen.
- Umfassende praktische Erfahrung in Laborabläufen, Analysetechniken und/oder mikrobiologischen Kultivierungstechniken.
- Allgemeines Verständnis chemischer und biochemischer Umwandlungen und molekularbiologischer Ansätze.
- Fähigkeit, auf Details zu achten, eigenständig zu forschen und zielorientiert zu arbeiten.
- Bereitschaft, in einem pluralistischen, kollegialen, internationalen und interdisziplinären Umfeld zu arbeiten.
- Ausgezeichnete englische Kommunikationsfähigkeiten (schriftlich und mündlich); sehr gute Fähigkeiten im wissenschaftlichen Schreiben
Vorteilhaft für diese Position:
- Erfahrung mit Sequenzierungsmethoden/-techniken der nächsten Generation
- Erfahrung mit DNA-Isolierung, PCR und Klonierungstechniken
- Isolierung von Bakterienstämmen, mikrobielle Kultivierungstechniken, phylogenomische Analysen
Arbeitszeit
39 Stunden pro Woche
Wir bieten:
- Moderne Labore und hochmoderne Instrumente
- Ein dynamisches und internationales Forschungsumfeld
- Umfangreiche Weiterbildungsmöglichkeiten und die Möglichkeit, sich in ein strukturiertes Promotionsprogramm einzuschreiben
- Ein einzigartiges Netzwerk exzellenter Partner zur Unterstützung Ihrer Forschungsvorhaben
- 30 Tage Urlaub (24.12. & 31.12. gelten als vollständig freie Tage)
- Eine jährliche Zusatzzahlung (Weihnachtsgeld) analog zu § 20 TVöD
- Inklusive Sozialversicherung
- Flexible Gestaltung von Arbeitszeit und Arbeitsort
- DO IT-Doktorandeninitiative https://www.helmholtz-hzi.de/de/karriere/do-it-doktorandeninitiative
- Willkommensbüro, Familienbüro
- Buddy-System für neue Doktoranden
Schwerbehinderte werden bei gleicher fachlicher Eignung bevorzugt. Das HIPS strebt eine Unternehmenskultur der Wertschätzung und Förderung der Chancengleichheit von Frauen und Männern an. Die Stelle ist teilzeitgeeignet.
Bewerbung:
Bewerber müssen das Online-Bewerbungsformular hier ausfüllen: https://hzi.opencampus.net/ (Bitte wählen Sie die Stellen-Nr. 129/2024)
