CoVerage analysiert Verbreitungsdynamik von SARS-CoV-2-Varianten
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CoVerage analysiert Verbreitungsdynamik von SARS-CoV-2-Varianten

HZI-Bioinformatiker:innen haben eine Webressource entwickelt, die die Verbreitung von SARS-CoV-2-Varianten prognostiziert

Das Online-Tool CoVerage analysiert die Verbreitungsdynamik der Varianten von SARS-CoV-2, ermittelt also, wie erfolgreich sich welche Virusvariante verbreitet. Als Datengrundlage verwendet die Webressource die Genom-Datenbank Gisaid. Gisaid ist eine internationale Initiative mit dem Ziel, Forschungsdaten schnell öffentlich verfügbar zu machen. Die Datenbank wird von Wissenschaftler:innen aus aller Welt zügig mit Genom-Sequenzen von Viren wie H1N1, Influenza oder SARS-CoV-2 gefüllt, sodass sie einen breiten Überblick über Mutationen und ihre genetischen Unterschiede ermöglicht. Um jedoch eine Prognose über die Verbreitungspotenziale dieser Mutationen abzugeben, reicht eine einfache Zählung der Inzidenzen nicht aus.

 

CoVerage ermöglicht eine Auswertung der epidemiologischen Dynamik verschiedener SARS-CoV-2-Varianten

Hier kommt die Webressource CoVerage ins Spiel. Damit lassen sich besonders erfolgreiche SARS-COV-2-Linien identifizieren und ihre weitere Verbreitung unter Berücksichtigung von epidemiologischen Informationen prognostizieren. Die Auswertung von CoVerage ermöglicht es außerdem, Aussagen über länderspezifische Entwicklungen zu treffen.

Entwickelt wurde CoVerage von Wissenschaftler:innen der HZI-Abteilung Bioinformatik der Infektionsforschung unter der Leitung von Prof. Alice McHardy.

Den freien Zugang zur Webressource gibt es unter: https://sarscoverage.org

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