Prof. Dr. Sébastien Calvignac-Spencer

Prof. Dr. Sébastien Calvignac-Spencer
Forschungsgruppenleiter
03834-3916-300

Sébastien Calvignac-Spencer studierte Biologie an der Universität Toulouse und der Universität Lyon, wo er 2007 promoviert wurde. Er kam 2010 als stellvertretender Leiter in die Gruppe von Fabian Leendertz ans RKI. Dort leitete er die Arbeitsgruppe zum Thema virale Evolution. Seit 2023 ist er Leiter der Abteilung Evolution von Krankheitserregern des Helmholtz-Instituts für One Health und Professor für Evolution von Krankheitserregern an der Universität Greifswald.

In seiner Forschung nutzt er die evolutionäre Genetik, um die komplexen Ursprünge von menschlichen und tierischen Krankheitserregern über große Zeiträume hinweg zu untersuchen - von aufkommenden Atemwegsviren des letzten Jahrhunderts wie dem Influenzavirus von 1918 bis hin zu langjährigen Begleitern der menschlichen Abstammung wie Herpes-Simplex-Viren. Er hat auch ein starkes Interesse daran, technische Grenzen auszuloten und neue Instrumente zu entwickeln. Mit seiner Arbeit leistete er Pionierarbeit bei der Verwendung wirbelloser Tiere als DNA-Probenehmer und weckte in jüngster Zeit das Interesse an alten, in Formalin fixierten Proben - sein Labor hat das bisher älteste Genom eines RNA-Virus, das den Menschen infiziert, aus einem Masernfall von 1912 gewonnen.

Sébastien Calvignac-Spencer ist Mitherausgeber mehrerer Fachzeitschriften (Virus Genes, Evolution, Medicine and Public Health, Molecular Ecology und Molecular Ecology Resources) und derzeit Vorsitzender der Polyomaviridae Studiengruppe des International Committee on Taxonomy of Viruses.

Publikationen

Hämmerle M., Guellil M., Trgovec-Greif L., Cheronet O., Sawyer S., Ruiz-Gartzia I., Lizano E., Rymbekova A., Gelabert P., Bernardi P., Han S., Rattei T., Schuenemann V.J., Marques-Bonet T., Guschanski K., Calvignac-Spencer S., ... , Pinhasi R., Kuhlwilm M. (2024)
Screening great ape museum specimens for DNA viruses
Sci.Rep., 14 (1)
DOI: 10.1038/s41598-024-80780-w HZI-Repositorium PubMed
Düx A., Lwitiho S.E., Ayouba A., Röthemeier C., Merkel K., Weiss S., Thaurignac G., Lander A., Kouadio L., Nowak K., Corman V., Drosten C., Couacy-Hymann E., Krüger D.H., Kurth A., Calvignac-Spencer S., Peeters M., Ntinginya N.E., ... , Leendertz F.H., Mangu C. (2024)
Detection of Bombali Virus in a Mops condylurus Bat in Kyela, Tanzania
Viruses, 16 (8)
DOI: 10.3390/v16081227 HZI-Repositorium PubMed
Gogarten J.F., Düx A., Gräßle T., Lumbu C.P., Markert S., Patrono L.V., Pleh K.A., Singa F.N., Tanga C.T.F., Tombolomako T.B., Couacy-Hymann E., Kouadio L., Ahuka-Mundeke S., Makouloutou-Nzassi P., ... , Calvignac-Spencer S., Leendertz F.H. (2024)
An ounce of prevention is better: Monitoring wildlife health as a tool for pandemic prevention
EMBO Rep.
DOI: 10.1038/s44319-024-00156-z HZI-Repositorium PubMed
Hämmerle M., Rymbekova A., Gelabert P., Sawyer S., Cheronet O., Bernardi P., Calvignac-Spencer S., Kuhlwilm M., ... , Guellil M., Pinhasi R. (2024)
Link between Monkeypox Virus Genomes from Museum Specimens and 1965 Zoo Outbreak
Emerging Infectious Diseases, 30 (4)
DOI: 10.3201/eid3004.231546 HZI-Repositorium PubMed
Zemella A., Beer K., Ramm F., Wenzel D., Düx A., Merkel K., Calvignac-Spencer S., Stern D., Dorner M.B., Dorner B.G., Widulin N., Schnalke T., Walter C., Wolbert A., Schmid B.G., ... , Mankertz A., Santibanez S. (2024)
Vaccine-induced neutralizing antibodies bind to the H protein of a historical measles virus
Int.J.Med.Microbiol., 314 (March 2024)
DOI: 10.1016/j.ijmm.2024.151607 HZI-Repositorium PubMed
Aghebatrafat A.A., Lauber C., Merkel K., Fruth B., Langergraber K., Robbins M.M., Wittig R.M., ... , Leendertz F.H., Calvignac-Spencer S. (2023)
Evolutionary Insight into the Association between New Jersey Polyomavirus and Humans
Viruses, 15 (11)
DOI: 10.3390/v15112248 HZI-Repositorium PubMed
Danabalan R., Merkel K., Baerholm Schnell I., Arandjelovic M., Boesch C., Brazzola G., Dieguez P., Dupain J., Kambale-Vyalengerera M., Kühl H.S., Hoffmann C., Lapuente J., Ngoc Thinh V., Zimmermann F., Leendertz F.H., Gilbert M.T.P., Roos C., Mazzoni C., ... , Gogarten J.F., Calvignac-Spencer S. (2023)
Mammal mitogenomics from invertebrate-derived DNA
Environ.DNA.
DOI: 10.1002/edn3.436 HZI-Repositorium
Lynggaard C., Calvignac-Spencer S., Chapman C.A., Kalbitzer U., Leendertz F.H., Omeja P.A., Opito E.A., Sarkar D., ... , Bohmann K., Gogarten J.F. (2023)
Vertebrate environmental DNA from leaf swabs
Curr.Biol., 33 (16)
DOI: 10.1016/j.cub.2023.06.031 HZI-Repositorium PubMed
Jahan M., Lagostina L., Gräßle T., Couacy-Hymann E., Kouadio L., Kouakou V.K., Krou H.A., Mossoun A.M., Patrono L.V., Pleh K., Steiner J.A., Yves N., Leendertz F.H., ... , Calvignac-Spencer S., Gogarten J.F. (2023)
Fly iDNA suggests strict reliance of the causative agent of sylvatic anthrax on rainforest ecosystems
Environmental DNA
DOI: 10.1002/edn3.401 HZI-Repositorium
Anoh E.A., Wayoro O., Monemo P., Belarbi E., Sachse A., Wilkinson E., San J.E., Leendertz F.H., Diané B., Calvignac-Spencer S., ... , Akoua-Koffi C., Schubert G. (2023)
Subregional origins of emerging SARS-CoV-2 variants during the second pandemic wave in Côte d'Ivoire
Virus Genes
DOI: 10.1007/s11262-023-01984-2 HZI-Repositorium
Jahan M., Calvignac-Spencer S., Chapman C.A., Kalbitzer U., Leendertz F.H., Omeja P.A., Sarkar D., ... , Ulrich M., Gogarten J.F. (2023)
The Movement of Pathogen Carrying Flies at the Human-Wildlife Interface
EcoHealth
DOI: 10.1007/s10393-022-01621-8 HZI-Repositorium PubMed
Gogarten J.F., Jahan M., Calvignac-Spencer S., Chapman C.A., Goldberg T.L., ... , Leendertz F.H., Rothman J.M. (2022)
The cost of living in larger primate groups includes higher fly densities
EcoHealth, 19 (2)
DOI: 10.1007/s10393-022-01597-5 HZI-Repositorium PubMed
Patrono L.V., Röthemeier C., Kouadio L., Couacy-Hymann E., Wittig R.M., ... , Calvignac-Spencer S., Leendertz F.H. (2022)
Non-invasive genomics of respiratory pathogens infecting wild great apes using hybridisation capture
Influ.Other Respir.Viruses, 16 (5)
DOI: 10.1111/irv.12984 HZI-Repositorium PubMed
Plenderleith L.J., Liu W., Li Y., Loy D.E., Mollison E., Connell J., Ayouba A., Esteban A., Peeters M., Sanz C.M., Morgan D.B., Wolfe N.D., Ulrich M., Sachse A., Calvignac-Spencer S., Leendertz F.H., Shaw G.M., ... , Hahn B.H., Sharp P.M. (2022)
Zoonotic origin of the human malaria parasite Plasmodium malariae from African apes
Nat.Commun., 13 (1)
DOI: 10.1038/s41467-022-29306-4 HZI-Repositorium PubMed
Hockings K.J., Mubemba B., Avanzi C., Pleh K., Düx A., Bersacola E., Bessa J., Ramon M., Metzger S., Patrono L.V., Jaffe J.E., Benjak A., Bonneaud C., Busso P., Couacy-Hymann E., Gado M., Gagneux S., Johnson R.C., Kodio M., Lynton-Jenkins J., Morozova I., Mätz-Rensing K., Regalla A., Said A.R., Schuenemann V.J., Sow S.O., Spencer J.S., Ulrich M., Zoubi H., Cole S.T., Wittig R.M., ... , Calvignac-Spencer S., Leendertz F.H. (2021)
Leprosy in wild chimpanzees
Nature, 598 (7882)
DOI: 10.1038/s41586-021-03968-4 HZI-Repositorium PubMed

Forschungsgruppe

Standort