- Forschungsgruppe
- RNA-Biologie bakterieller Infektionen
- Einstellungszeitpunkt
- Zum nächstmöglichen Zeitpunkt
- Befristung
- Zunächst befristet für zwei Jahre
- Probezeit
- 6 Monate
- Vergütung
- E13 TVöD Bund
- Bewerbungsfrist
- 18.08.2024
Die Teams von Vogel (HIRI, Würzburg) und Smyth (IBMC, Straßburg) suchen einen Postdoktoranden, der die molekularen Mechanismen von Antibiotika auf der Basis von Antisense-Peptid-Nukleinsäuren (PNA) untersucht. PNAs sind DNA-Nachahmer mit einem ungeladenen Grundgerüst, die Nukleinsäuren mit Sequenzspezifität und hoher Affinität binden. PNAs, die auf mRNAs essentieller bakterieller Gene abzielen, zeigen bakterizide Wirkungen in verschiedenen mikrobiellen Spezies, aber unser mechanistisches Verständnis der PNA-Aktivität und ihres Zielgenspektrums ist begrenzt. Insbesondere ist die PNA-vermittelte Wachstumshemmung nicht durchgängig mit einer Verarmung der Ziel-mRNA verbunden, und es ist immer noch nicht bekannt, wie ein mögliches Off-Targeting minimiert werden kann.
In diesem gemeinsamen Projekt wird das Fachwissen des Vogel-Labors auf dem Gebiet der PNA-Antibiotika mit dem Fachwissen des Smyth-Labors auf dem Gebiet der RNA-Struktursondierung kombiniert. Konkretes Ziel ist es, die Bindungsregeln von PNAs an ihre Zielnukleinsäuren zu definieren und zu verstehen, wie sich dies auf mRNA-Funktionen wie die Translation auswirkt. Letztendlich wird dies den Weg für die gezielte Abtötung pathogener Bakterien und/oder die präzise Bearbeitung der menschlichen Mikrobiota zu therapeutischen Zwecken ebnen.
Aufgaben
- Verantwortlich für den Inhalt der Forschungsaufgaben
- Planung und Durchführung von Experimenten
- Erstellung von wissenschaftlichen Publikationen
- Vorbereitung und Halten von Vorträgen in englischer Sprache auf nationaler und internationaler Ebene
- Betreuung von wissenschaftlichen Hilfskräften, Doktoranden, Master-/Bachelorstudenten
Voraussetzungen
- Erfolgreich abgeschlossenes Hochschul- oder Masterstudium in Naturwissenschaften
- Promotion (FR Molekularbiologie, Biochemie oder in einem verwandten Bereich der Biowissenschaften)
- Erfahrung in der Analyse von RNA-Strukturen oder der Arbeit mit mikrobiellen Kulturen ist wünschenswert
- Interesse an Data Science wäre von Vorteil
- Sehr gute Kommunikationsfähigkeiten und Wertschätzung von Kreativität und Zusammenarbeit
- Selbstständiges Arbeiten und Begeisterung für die Arbeit im Team
- Begeisterung für ein dynamisches und internationales Arbeitsumfeld, Zuverlässigkeit und Verantwortungsbewusstsein sowie hohe wissenschaftliche Standards
- Fähigkeit und Bereitschaft, regelmäßig zwischen Frankreich und Deutschland zu reisen, unerlässlich
- Sehr gute Englischkenntnisse in Wort und Schrift
- Hoch motiviert, organisiert und kreativ
- Ausgeprägte Publikationsfreudigkeit in der jeweiligen Karrierestufe
Arbeitszeit
39 Stunden pro Woche
Wir bieten Ihnen:
- Eine attraktive und abwechslungsreiche Tätigkeit in einem zukunftsorientierten Forschungsinstitut mit einem internationalen Umfeld am Science Campus Süd
in Braunschweig - Eine hochmoderne Infrastruktur und modernste Technologien
- Flexible Arbeitszeitgestaltung, Teilzeitmodelle
- Eine Unternehmenskultur der Wertschätzung und Förderung der Chancengleichheit
- Umfangreiche Fort- und Weiterbildungsmöglichkeiten zur Entwicklung fachlicher Kenntnisse und persönlicher Fähigkeiten
- Ein Familienbüro zur Unterstützung von Familie und Beruf sowie Angebote der Kinderbetreuung
- Interessante Zusatzleistungen des öffentlichen Dienstes
- Bezuschussung des D-Job-Tickets
Bei gleicher fachlicher Eignung erhalten Schwerbehinderte den Vorzug. Zur Wahrung Ihrer Rechte bitten wir Sie, uns bereits in Ihrem Anschreiben oder Lebenslauf einen gut erkennbaren Hinweis auf das Vorliegen eines Grades einer Schwerbehinderung zu geben.
Die Anstellung erfolgt über das Helmholtz-Zentrum für Infektionsforschung GmbH (HZI) in Braunschweig. Der Dienstort ist Würzburg.
Das HZI engagiert sich aktiv für Gleichstellung, Vielfalt und Integration. Aus diesem Grund verfolgt das HZI das Ziel der beruflichen Gleichstellung von Frauen und Männern. Die Stelle ist teilzeitgeeignet.
So bewerben Sie sich:
Bitte bestätigen Sie uns zusammen mit der Zusendung Ihrer Bewerbungsunterlagen die Kenntnisnahme unserer Datenschutzerklärung und Ihre Einwilligung in die Verarbeitung Ihrer personenbezogenen Daten. Bitte nutzen Sie dafür den Textbaustein in unserer Datenschutzerklärung. Ohne diese Erklärungen können wir Ihre Bewerbung nicht berücksichtigen bzw. weiterbearbeiten und werden bereits eingegangene Bewerbungsunterlagen nach Ablauf der Bewerbungsfrist unverzüglich löschen.
Bitte fügen Sie Ihren Bewerbungsunterlagen ein Anschreiben, einen Lebenslauf, (Arbeits-) Zeugnisse, Zertifikate und (wenn vorhanden) Arbeitsproben oder Referenzprojekte bei. Bitte verzichten Sie auf die Einsendung eines Fotos.
Ihre Unterlagen senden Sie bitte unter Angabe der Kennziffer 084/2024 an das Helmholtz-Zentrum für Infektionsforschung GmbH, Personalabteilung, Inhoffenstr. 7, 38124 Braunschweig oder per E-Mail. Bei Zusendung Ihrer Bewerbung in elektronischer Form bitten wir um Zusammenfassung in einem (1) PDF-Dokument.
Wir freuen uns auf Ihre Bewerbung!
Über das HIRI
Das Helmholtz-Institut für RNA-basierte Infektionsforschung (HIRI) ist die weltweit erste Einrichtung ihrer Art, die die Forschung an Ribonukleinsäuren (RNA) mit der Infektionsbiologie vereint. Auf Basis neuer Erkenntnisse aus seinem starken Grundlagenforschungsprogramm will das Institut innovative therapeutische Ansätze entwickeln, um menschliche Infektionen besser diagnostizieren und behandeln zu können. Das HIRI ist ein Standort des Braunschweiger Helmholtz-Zentrums für Infektionsforschung (HZI) in Kooperation mit der Julius-Maximilians-Universität Würzburg (JMU) und befindet sich auf dem Würzburger Medizin-Campus. Weitere Informationen unter www.helmholtz-hiri.de.
Weitere Informationen über unsere Forschung:
https://www.helmholtz-hiri.de/en/research/organisation/people/person/prof-joerg-vogel/
Das Vogel-Labor erforscht nicht-kodierende RNA und RNA-bindende Proteine von bakteriellen Pathogenen, Phagen und anderen Mitgliedern des menschlichen Mikrobioms. Sie entwickeln Deep Sequencing-basierte Techniken wie Single-Cell RNA-seq, Dual RNA-seq und Grad-seq, um die Molekularbiologie dieser Organismen umfassend zu untersuchen. Sie versuchen aufzuklären, wie Bakterien RNA als Regulator während der Infektion nutzen, und leisten Pionierarbeit bei der Entwicklung von RNA-basierten Therapeutika, um diese Krankheitserreger präzise zu bekämpfen.
- Popella L, Jung J, Do PT, Hayward RJ, Barquist L, Vogel J. Comprehensive analysis of PNA-based antisense antibiotics targeting various essential genes in uropathogenic Escherichia coli. Nucleic Acids Res. 2022 Jun 24;50(11):6435-6452. doi: 10.1093/nar/gkac362. PMID: 35687096; PMCID: PMC9226493.
- Hör J, Jung J, Ðurica-Mitić S, Barquist L, Vogel J. INRI-seq enables global cell-free analysis of translation initiation and off-target effects of antisense inhibitors. Nucleic Acids Res. 2022 Dec 9;50(22):e128. doi: 10.1093/nar/gkac838. PMID: 36229039; PMCID: PMC9825163.
https://www.helmholtz-hiri.de/en/research/organisation/people/person/redmond-smyth/
Das Smyth-Labor erforscht die Rolle der RNA-Struktur bei der Regulierung viraler Infektionsprozesse. Sie verwenden molekulare Virologie, RNA-Biochemie und fortschrittliche RNA-Struktursondierungstechnologien, um die Beziehungen zwischen RNA-Struktur und -Funktion zu entschlüsseln. Ihr Ziel ist es, konservierte und essentielle Strukturelemente zu identifizieren, die Ziele für RNA-basierte Therapeutika sein könnten.
- Gribling-Burrer AS, Bohn P, Smyth RP. Isoform-spezifische RNA-Strukturbestimmung mittels Nano-DMS-MaP. Nat Protoc. 2024 Feb 12. doi: 10.1038/s41596-024-00959-3. Epub ahead of print. PMID: 38347203.
- Bohn P, Gribling-Burrer AS, Ambi UB, Smyth RP. Nano-DMS-MaP ermöglicht isoformspezifische RNA-Strukturbestimmung. Nat Methods. 2023 Jun;20(6):849-859. doi: 10.1038/s41592-023-01862-7. Epub 2023 Apr 27. PMID: 37106231; PMCID: PMC10250195.
